暗黑圣战并非一场单一的战役，而是阿拉德历中持续近百年的对抗伪装者的战争总称。故事起源于混沌之神奥兹玛与毁灭之王卡赞的悲剧——他们曾是佩鲁斯帝国的将军，因皇帝的猜忌与陷害，卡赞被处死，奥兹玛则与死神签订契约，化为混沌的化身，发誓向所有人类复仇。奥兹玛用血之诅咒感染人类，使其变异为失去理智、渴望鲜血的“伪装者”，战火迅速蔓延至整个贝尔玛尔公国与德洛斯帝国边境。
当伪装者瘟疫爆发时，人类军队在它们面前溃不成军，因为伪装者保留了生前的战斗技巧，且拥有超乎常人的再生能力。绝望之际，圣职者教团应运而生——他们由五名初代圣者创立，掌握了对抗诅咒的圣力。教团内部发展出多个流派：擅长近战驱魔的“驱魔师”，使用圣光法术的“圣骑士”，以及背负复仇使命的“蓝拳圣使”。其中最著名的领袖是“圣者米歇尔”，他带领教团在“黑色大地”建立了第一座防线。
暗黑圣战的高潮发生于黑色大地的最终决战。米歇尔与奥兹玛在绝望之塔前展开对决，最终米歇尔以自身性命为代价，将奥兹玛封印在异次元空间，但封印并不完美，奥兹玛的残魂仍能通过时空裂缝影响阿拉德。这场战役后，黑色大地被彻底扭曲，成为遍布怪物与剧毒之地的禁地，即后来的“暗黑城”区域，玩家在游戏中挑战的“暗黑城入口”与“异界地下城”副本，正是这段历史的缩影。
暗黑圣战对职业体系的影响极为深远：圣职者职业的转职分支，如“圣骑士”可以学习净化诅咒的圣光系技能，“驱魔师”则擅长用符咒与巨兵对抗不死生物，这些技能背后的设定均源于此战。而“伪装者”这一敌人类型贯穿始终，从早期寂静城的“鲜血伪装者”到后期副本中的“混沌奥兹玛”，成为玩家最熟悉的怪物种族之一。
在剧情层面，暗黑圣战彻底改变了阿拉德的政治格局。佩鲁斯帝国因将军的背叛而衰落，帝国分裂为德洛斯帝国与虚祖王国，而贝尔玛尔公国在战后宣布中立。圣职者教团则成为独立于国家的大型组织，他们管理的“赫顿玛尔”教堂成为玩家日常活动的中心。更深远的是，对奥兹玛的封印，为后续大转移事件埋下了伏笔——当封印松动时，阿拉德大陆发生了剧烈空间扭曲，多个城镇破碎，直接导致了游戏世界观从“旧阿拉德”向“新阿拉德”演变。
对于玩家而言，暗黑圣战不仅是背景故事，也直接体现于游戏机制中。例如，圣职者角色在释放“净化”类技能时，会附带对不死系敌人的额外伤害；而“异界地下城”中的“奥兹玛裂痕”副本，要求玩家在规定时间内破坏祭坛，否则会触发全屏诅咒，这些设计都在致敬历史事件。此外，每年周年庆或特殊版本中，官方会推出“黑色大地”复刻活动，让新老玩家重温这场决定阿拉德命运的战争。